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Avaliação de métodos de estimação de componentes de variância utilizando dados simulados R. Bras. Zootec.
Carneiro Júnior,José Marques; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida.
Estudos de simulação foram conduzidos com o objetivo de realizar análise comparativa entre os métodos de estimação de componentes de variância: método da máxima verossimilhança restrita (REML), método da máxima verossimilhança (ML) e método III de Henderson. Todos os três métodos foram utilizados com modelo reprodutor, e o método REML foi utilizado também com modelo animal. Objetivou-se verificar, principalmente, o efeito do desbalanceamento na estimação dos componentes de variância. Foi simulado um genoma, constituído de uma única característica quantitativa governada por 200 locos. O genoma foi utilizado na construção de três populações-base com herdabilidades de 0,60, 0,30 e 0,10, constituídas de 1000 animais (500 machos e 500 fêmeas). A partir de cada...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Componentes de variância; Estimação/métodos; Melhoramento animal; Simulação.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000200008
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Estimação de componentes de variância sob influência de genes de efeito principal, comparando-se metodologias Bayesiana e clássica sob diferentes cenários R. Bras. Zootec.
Assis,Giselle Mariano Lessa de; Carneiro Júnior,José Marques; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio.
Quatro diferentes tipos de população foram simulados com o objetivo de verificar a influência de genes de efeito principal e do tamanho da população na estimação de componentes de variância sob seleção. A estimação foi realizada por meio da utilização e comparação das metodologias clássica e Bayesiana (a Bayesiana com três níveis de informação a priori). As metodologias REML e Bayesiana com prior não-informativo, em geral, produziram resultados bastante semelhantes. Em populações cuja característica é governada por genes de efeito principal, as estimativas dos componentes de variância genética aditiva foram pouco acuradas, exceto quando se utilizou metodologia Bayesiana com prior informativo. A inclusão das informações de parentesco e dos registros de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amostragem de Gibbs; Modelo infinitesimal; Modelos mistos; REML; Simulação computacional; Viés da seleção.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000600007
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Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e freqüentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias R. Bras. Zootec.
Carneiro Júnior,José Marques; Assis,Giselle Mariano Lessa de; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio.
Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans de comprimento considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas que formaram a população-base. A partir da população-base foram formadas duas populações iniciais, uma grande e outra pequena. Dois tipos de estruturas de heterogeneidade de variâncias foram inseridos nas populações iniciais: heterogeneidade de variância genética aditiva e heterogeneidade de variâncias genética aditiva e ambiental. Para obtenção destas estruturas, foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amostragem de Gibbs; Heterocedasticidade; Informação a priori; Melhoramento animal; Parâmetros genéticos; Simulação.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000700012
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Estimação de parâmetros genéticos em caprinos leiteiros por meio de análise de regressão aleatória utilizando-se a Amostragem de Gibbs R. Bras. Zootec.
Assis,Giselle Mariano Lessa de; Albuquerque,Lucia Galvão de; Sarmento,José Lindenberg Rocha; Carneiro Júnior,José Marques; Lopes,Paulo Sávio; Rodrigues,Marcelo Teixeira.
Modelos de regressão aleatória foram utilizados neste estudo para estimar parâmetros genéticos da produção de leite no dia do controle (PLDC) em caprinos leiteiros da raça Alpina, por meio da metodologia Bayesiana. As estimativas geradas foram comparadas às obtidas com análise de regressão aleatória, utilizando-se o REML. As herdabilidades encontradas pela análise Bayesiana variaram de 0,18 a 0,37, enquanto, pelo REML, variaram de 0,09 a 0,32. As correlações genéticas entre dias de controle próximos se aproximaram da unidade, decrescendo gradualmente conforme a distância entre os dias de controle aumentou. Os resultados obtidos indicam que: a estrutura de covariâncias da PLDC em caprinos ao longo da lactação pode ser modelada adequadamente por meio da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Análise Bayesiana; Caprinocultura leiteira; Componentes de variância; Correlação genética.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000300011
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Estimation of variances of the effects of incomplete diallels using a matrix approach Genet. Mol. Biol.
Assis,Giselle Mariano Lessa de; Fonseca,Ricardo da; Cruz,Cosme Damião; Carneiro Júnior,José Marques.
A matrix approach is described for assessing the variance of effects in incomplete diallels designs. The method is illustrated by reference to simulated complete and incomplete diallels using different combinations of constraints, average degree of dominance and, for the incomplete diallel, number of hybrids. Our results showed that caution should be taken in working with incomplete diallels under conditions of overdominance because there were changes in the rank of the genotypes when the excluded hybrid had parents with a low frequency of the favorable allele (i.e. the allele which increases expression of a character). The expression described in this paper is a rapid and safe approach to estimate variances and covariances of the effects of contrasts of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Incomplete diallel; General combining ability; Specific combining ability.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572004000300017
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Estimativas de parâmetros genéticos para altura do posterior, peso e circunferência escrotal em bovinos da raça Nelore R. Bras. Zootec.
Yokoo,Marcos Jun Iti; Albuquerque,Lucia Galvão de; Lôbo,Raysildo Barbosa; Sainz,Roberto Daniel; Carneiro Júnior,José Marques; Bezerra,Luiz Antônio Framartino; Araujo,Fabiano Rodrigues da Cunha.
Visando estimar parâmetros genéticos em bovinos, foram utilizados registros de pesos padronizados aos 120, 210, 365, 450 e 550 dias de idade (P120, P210, P365, P450 e P550), altura do posterior mensurada próxima ao sobreano (ALT) e circunferências escrotais (CE) padronizadas aos 365, 450 e 550 dias de idade (CE365, CE450 e CE550). Os dados foram provenientes de animais machos e fêmeas, nascidos entre 1998 e 2003 em dez fazendas de seis estados brasileiros. Os componentes de (co)variância foram estimados pela metodologia REML em análises uni, bi e trivariadas, utilizando-se modelos animal. As estimativas de herdabilidade do efeito direto com os respectivos erros-padrão foram: ALT 0,63 (0,09), P120 0,25 (0,03), P210 0,34 (0,03), P365 0,45 (0,04), P450 0,48...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos indicus; Correlações genéticas; Gado de corte; Herdabilidade; Peso padronizado.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000800008
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Influência da informação a priori na avaliação genética animal utilizando dados simulados R. Bras. Zootec.
Carneiro Júnior,José Marques; Assis,Giselle Mariano Lessa de; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio.
Estudos de simulação foram conduzidos com o objetivo de verificar a influência da informação a priori nas avaliações genéticas dos animais. Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans, considerando-se uma única característica quantitativa, determinada por 800 locos, com dois alelos por loco, na qual a herdabilidade variou de 0,40 a 0,60. Foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas, que formaram a população-base. A partir da população-base, foram formados três tamanhos de populações: POP1 (100 animais), POP2 (300 animais) e POP3 (1.600 animais). Foram empregados três níveis de informação a priori: priors não-informativos (PNI), priors pouco informativos (PPI) e priors informativos (PI). Foram avaliadas também as conseqüências de se incluir nas análises...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Análise Bayesiana; Componentes de variância; Informação a priori; Parâmetros genéticos; Simulação.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000600014
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Seleção de genótipos de amendoim forrageiro para cobertura do solo e produção de biomassa aérea no período de estabelecimento utilizando-se metodologia de modelos mistos R. Bras. Zootec.
Assis,Giselle Mariano Lessa de; Valentim,Judson Ferreira; Carneiro Júnior,José Marques; Azevedo,José Marlo Araújo de; Ferreira,Aliedson Sampaio.
Objetivou-se estimar parâmetros genéticos e selecionar genótipos de amendoim forrageiro para maior cobertura do solo e produção de biomassa aérea durante o período de estabelecimento nas condições ambientais do Acre. A área experimental foi estabelecida em dezembro de 2005. O experimento foi realizado em delineamento de blocos ao acaso com quatro repetições utilizando-se 21 genótipos de amendoim forrageiro, incluindo três cultivares (Amarillo, Alqueire 1 e Belmonte). A seleção dos genótipos foi realizada considerando a cobertura do solo e a produção de matéria seca. As avaliações de cobertura do solo foram realizadas entre janeiro e outubro de 2006, em intervalos de quatro semanas. A produção de matéria seca foi mensurada 304 dias após o plantio. Os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Arachis; BLUP; Dados longitudinais; Leguminosas forrageiras; Parâmetros genéticos; REML.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001100001
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